57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3756 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  100 
 
 		 573 aa  1131    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  65.38 
 
 		 574 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  66.61 
 
 		 577 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  64.41 
 
 		 578 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  63.72 
 
 		 610 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  62.04 
 
 		 573 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  55.32 
 
 		 577 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  53.76 
 
 		 563 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.77 
 
 		 632 aa  280  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.99 
 
 		 633 aa  266  7e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  31.94 
 
 		 637 aa  257  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.5 
 
 		 637 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.31 
 
 		 633 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  31.94 
 
 		 633 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.16 
 
 		 630 aa  253  6e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.01 
 
 		 633 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  31.91 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  31.91 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  31.42 
 
 		 619 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.27 
 
 		 640 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.2 
 
 		 631 aa  249  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.55 
 
 		 631 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.02 
 
 		 638 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.28 
 
 		 620 aa  246  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.95 
 
 		 645 aa  246  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.48 
 
 		 636 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.84 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  32.74 
 
 		 607 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.84 
 
 		 635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.04 
 
 		 647 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.89 
 
 		 634 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.8 
 
 		 644 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.49 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  32.01 
 
 		 635 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.31 
 
 		 634 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.41 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  30.63 
 
 		 625 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.23 
 
 		 631 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  31.16 
 
 		 624 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  28.19 
 
 		 631 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.47 
 
 		 612 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.57 
 
 		 604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  31.1 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  39.8 
 
 		 637 aa  229  8e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  39.68 
 
 		 626 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  39.47 
 
 		 633 aa  224  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  33.09 
 
 		 622 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  39.14 
 
 		 632 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  37.91 
 
 		 633 aa  217  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.51 
 
 		 622 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  36.21 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  31.35 
 
 		 582 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  30.77 
 
 		 584 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  26.9 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24.41 
 
 		 584 aa  50.4  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  28.41 
 
 		 634 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  22.77 
 
 		 638 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>