56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2329 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.97 
 
 		 634 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.77 
 
 		 631 aa  665    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  56.41 
 
 		 633 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  56.91 
 
 		 637 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.02 
 
 		 631 aa  667    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.53 
 
 		 637 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.77 
 
 		 638 aa  673    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.74 
 
 		 637 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.6 
 
 		 647 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 612 aa  1234    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.71 
 
 		 630 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.47 
 
 		 640 aa  645    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.54 
 
 		 634 aa  646    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.41 
 
 		 633 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.34 
 
 		 644 aa  644    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.3 
 
 		 632 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  56.12 
 
 		 633 aa  644    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.59 
 
 		 633 aa  661    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  56.91 
 
 		 633 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  57.05 
 
 		 635 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.84 
 
 		 631 aa  652    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  64.19 
 
 		 604 aa  772    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  65.15 
 
 		 607 aa  783    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.79 
 
 		 633 aa  645    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.57 
 
 		 645 aa  658    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.07 
 
 		 631 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.23 
 
 		 636 aa  633  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.9 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.9 
 
 		 635 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.34 
 
 		 620 aa  611  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  53.4 
 
 		 624 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  54.89 
 
 		 619 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  54.89 
 
 		 619 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.72 
 
 		 632 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  53.81 
 
 		 626 aa  595  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.93 
 
 		 633 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.89 
 
 		 625 aa  591  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  54.22 
 
 		 619 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.85 
 
 		 622 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  49.34 
 
 		 631 aa  569  1e-161  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  50.49 
 
 		 633 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  49.3 
 
 		 622 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  33.45 
 
 		 577 aa  253  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  34.32 
 
 		 574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  32.6 
 
 		 578 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  30.96 
 
 		 577 aa  237  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  39.02 
 
 		 563 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  32.72 
 
 		 573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.41 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  37.09 
 
 		 573 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  32.23 
 
 		 582 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  32.97 
 
 		 584 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  32.81 
 
 		 567 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  29.74 
 
 		 788 aa  96.7  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24.25 
 
 		 584 aa  47.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.63 
 
 		 629 aa  45.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>