65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0221 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  100 
 
 
622 aa  1211    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.27 
 
 
640 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  49.43 
 
 
638 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.36 
 
 
633 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  50.73 
 
 
631 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.13 
 
 
634 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.9 
 
 
630 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  49.21 
 
 
631 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  48.81 
 
 
633 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.59 
 
 
631 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  49.36 
 
 
634 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  47.2 
 
 
633 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.49 
 
 
632 aa  538  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  50.4 
 
 
633 aa  535  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.72 
 
 
633 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  47.99 
 
 
644 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  50 
 
 
645 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.23 
 
 
635 aa  532  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.23 
 
 
635 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  51.17 
 
 
636 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  49.03 
 
 
635 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.08 
 
 
631 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  50.69 
 
 
647 aa  528  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  46.2 
 
 
633 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  49.75 
 
 
633 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  47.71 
 
 
637 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  45.32 
 
 
637 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  45.32 
 
 
633 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  49.47 
 
 
612 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  48.62 
 
 
632 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  45.45 
 
 
637 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  50.83 
 
 
622 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  41.9 
 
 
631 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  46.61 
 
 
604 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  46.75 
 
 
607 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  46.63 
 
 
625 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  46.76 
 
 
620 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  45.72 
 
 
624 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  45.22 
 
 
619 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  45.22 
 
 
619 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  45.44 
 
 
626 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  44.77 
 
 
619 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  35.79 
 
 
563 aa  261  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  35.25 
 
 
577 aa  232  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  34.78 
 
 
577 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  34.07 
 
 
610 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  34.15 
 
 
573 aa  208  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  35.28 
 
 
574 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  34.23 
 
 
578 aa  201  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  39.41 
 
 
573 aa  187  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  34.88 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  31.3 
 
 
584 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
582 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  26.81 
 
 
788 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  25.73 
 
 
599 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  21.71 
 
 
547 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  22.04 
 
 
628 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  22.04 
 
 
628 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  21.83 
 
 
547 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  25.37 
 
 
584 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  25.4 
 
 
533 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  37.88 
 
 
601 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  24.13 
 
 
634 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
615 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.04 
 
 
629 aa  43.9  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>