62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0497 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.72 
 
 		 634 aa  832    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  52.94 
 
 		 631 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  87.05 
 
 		 633 aa  1116    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  62.34 
 
 		 637 aa  751    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.34 
 
 		 612 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.9 
 
 		 631 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.96 
 
 		 637 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.8 
 
 		 638 aa  742    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.43 
 
 		 637 aa  832    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.56 
 
 		 635 aa  816    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.24 
 
 		 647 aa  689    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  62.01 
 
 		 633 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.51 
 
 		 630 aa  830    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.5 
 
 		 640 aa  819    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.63 
 
 		 636 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 634 aa  1290    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.59 
 
 		 633 aa  747    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.61 
 
 		 644 aa  835    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  66.56 
 
 		 635 aa  816    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  67.8 
 
 		 632 aa  823    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  59.68 
 
 		 633 aa  745    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.58 
 
 		 633 aa  754    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.72 
 
 		 620 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  84.09 
 
 		 635 aa  1093    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  93.2 
 
 		 631 aa  1201    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.54 
 
 		 631 aa  751    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  90.19 
 
 		 633 aa  1144    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  93.98 
 
 		 631 aa  1190    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  85.04 
 
 		 645 aa  1098    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.43 
 
 		 632 aa  629  1e-179  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  52.28 
 
 		 624 aa  614  9.999999999999999e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  52.57 
 
 		 626 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  53.65 
 
 		 619 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.59 
 
 		 633 aa  604  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  53.65 
 
 		 619 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.73 
 
 		 607 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.64 
 
 		 604 aa  594  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  51.67 
 
 		 619 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  50.16 
 
 		 625 aa  586  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.05 
 
 		 622 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  51.22 
 
 		 633 aa  581  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  49.27 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  33.27 
 
 		 577 aa  253  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  33.03 
 
 		 563 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  32.82 
 
 		 578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  33.52 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31 
 
 		 577 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  31.34 
 
 		 573 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  30.67 
 
 		 573 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  39.08 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 		 582 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  31.21 
 
 		 584 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.04 
 
 		 788 aa  93.2  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  31.7 
 
 		 567 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  27.8 
 
 		 599 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  27.84 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 		 634 aa  47  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  21.85 
 
 		 629 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 547 aa  43.9  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  23.66 
 
 		 628 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  23.66 
 
 		 628 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  27.11 
 
 		 547 aa  43.9  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>