99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0978 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  75.97 
 
 		 628 aa  988    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1294    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  75.97 
 
 		 628 aa  988    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  38.08 
 
 		 638 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  32.97 
 
 		 634 aa  330  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  34.15 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  33.44 
 
 		 626 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  34.15 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.15 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  33.44 
 
 		 626 aa  298  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  33.28 
 
 		 627 aa  293  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  33.55 
 
 		 627 aa  293  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  33.11 
 
 		 627 aa  293  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 627 aa  293  9e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 		 627 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 		 627 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1682  Nitric oxide reductase activation protein-like protein  24.23 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1790  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.04 
 
 		 678 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00221847  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1588  von Willebrand factor type A  36.04 
 
 		 610 aa  60.1  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.778947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 		 636 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2091  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity  26.83 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 		 766 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3133  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 		 1006 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  25.91 
 
 		 769 aa  54.7  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 781 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  29.03 
 
 		 631 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  23.47 
 
 		 757 aa  51.2  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.81 
 
 		 631 aa  50.8  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  24.68 
 
 		 584 aa  50.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06840  putative dinitrification protein NorD  26.81 
 
 		 612 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 		 785 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.88 
 
 		 632 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  24.32 
 
 		 578 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2120  von Willebrand factor, type A  22.93 
 
 		 647 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0626  putative dinitrification protein NorD  26.81 
 
 		 612 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  25.84 
 
 		 599 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3186  nitric oxide reductase D protein  37.84 
 
 		 644 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  25.28 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.88 
 
 		 630 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1253  von Willebrand factor, type A  30.83 
 
 		 677 aa  48.9  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.88 
 
 		 635 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1847  nitric oxide reductase activation protein  35.14 
 
 		 645 aa  48.9  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0555  putative nitric oxide reductase activation protein  26.47 
 
 		 614 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.88 
 
 		 635 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  22.64 
 
 		 577 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.88 
 
 		 636 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.63 
 
 		 638 aa  48.5  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  25.95 
 
 		 577 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  26.83 
 
 		 624 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  24.56 
 
 		 574 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1518  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 		 650 aa  47.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2324  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.27 
 
 		 618 aa  47.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.28516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0868  nitric oxide reductase activation protein  22.97 
 
 		 705 aa  47.8  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4389  von Willebrand factor type A  32.91 
 
 		 633 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664714  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1327  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 		 600 aa  47.8  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2605  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 637 aa  47.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2636  rubisco activation protein cbbO  23.47 
 
 		 773 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3197  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.62 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  24.71 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  24.53 
 
 		 633 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.56 
 
 		 604 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1092  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 756 aa  47  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.53 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.79 
 
 		 637 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  23.81 
 
 		 777 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3117  von Willebrand factor, type A  35.44 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  24.71 
 
 		 689 aa  47  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  23.39 
 
 		 573 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 		 773 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0251  norD protein  21.96 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  23.48 
 
 		 625 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2481  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 		 638 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  25.15 
 
 		 635 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.22 
 
 		 633 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  26.25 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.64 
 
 		 640 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  27.22 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0227  norD protein  21.97 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.902062  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0602  hypothetical protein  23.17 
 
 		 558 aa  45.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0984016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  24.53 
 
 		 633 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.75 
 
 		 647 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  27.05 
 
 		 785 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.29 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3639  von Willebrand factor type A  22.5 
 
 		 578 aa  45.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411957  normal  0.0746298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.81 
 
 		 644 aa  44.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2683  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 913 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.44 
 
 		 612 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  25.62 
 
 		 633 aa  44.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.29 
 
 		 631 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0321  NorD nitric oxide reductase activation protein  35.29 
 
 		 624 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.71 
 
 		 631 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  26.04 
 
 		 622 aa  43.9  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1966  von Willebrand factor, type A  32.46 
 
 		 624 aa  44.3  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.12 
 
 		 645 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1979  von Willebrand factor, type A  33.78 
 
 		 647 aa  43.9  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>