60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4519 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  65.92 
 
 
578 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  64.91 
 
 
577 aa  686    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  87.66 
 
 
610 aa  953    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  100 
 
 
573 aa  1134    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  65.79 
 
 
574 aa  693    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  62.25 
 
 
573 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  55.35 
 
 
577 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  49.2 
 
 
563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.45 
 
 
633 aa  247  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.17 
 
 
632 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.33 
 
 
637 aa  239  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.31 
 
 
647 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.08 
 
 
633 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.61 
 
 
612 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.72 
 
 
633 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.6 
 
 
620 aa  233  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.72 
 
 
640 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  31.38 
 
 
607 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  30.5 
 
 
637 aa  227  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.12 
 
 
645 aa  226  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.9 
 
 
630 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  29.08 
 
 
631 aa  226  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  30.33 
 
 
633 aa  224  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  32.03 
 
 
624 aa  223  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  31.84 
 
 
619 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.59 
 
 
631 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  30.56 
 
 
635 aa  221  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.43 
 
 
631 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.09 
 
 
631 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  31.84 
 
 
619 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.65 
 
 
633 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  31.84 
 
 
619 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.19 
 
 
644 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.11 
 
 
631 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.34 
 
 
634 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.55 
 
 
604 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  30.62 
 
 
626 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.2 
 
 
636 aa  213  9e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  38.49 
 
 
625 aa  212  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.9 
 
 
632 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.2 
 
 
635 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.2 
 
 
635 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  40.14 
 
 
637 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  28.78 
 
 
633 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  38.25 
 
 
633 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  39.79 
 
 
638 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.67 
 
 
622 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  40.14 
 
 
634 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  42.41 
 
 
622 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  39.08 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  35.68 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  31.72 
 
 
584 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
582 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  26.7 
 
 
788 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  25.31 
 
 
584 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 
631 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  23.15 
 
 
628 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  23.15 
 
 
628 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  23.39 
 
 
629 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
634 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>