77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1995 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  100 
 
 		 563 aa  1103    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  49.37 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  53.23 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  47.36 
 
 		 577 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  49.38 
 
 		 574 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  49.2 
 
 		 573 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  49.19 
 
 		 610 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  48.87 
 
 		 578 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  32.98 
 
 		 633 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.1 
 
 		 631 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.71 
 
 		 647 aa  277  4e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  35.52 
 
 		 630 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.75 
 
 		 633 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.75 
 
 		 633 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.63 
 
 		 638 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.61 
 
 		 635 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.61 
 
 		 635 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.39 
 
 		 632 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.15 
 
 		 637 aa  263  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  33.21 
 
 		 635 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.99 
 
 		 620 aa  255  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  40 
 
 		 640 aa  253  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.03 
 
 		 634 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  31.19 
 
 		 619 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  31.19 
 
 		 619 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  43.17 
 
 		 632 aa  250  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.76 
 
 		 631 aa  249  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  40.3 
 
 		 633 aa  249  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.3 
 
 		 631 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  31.57 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.21 
 
 		 622 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  42.11 
 
 		 637 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.11 
 
 		 637 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.43 
 
 		 636 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  30.46 
 
 		 619 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.43 
 
 		 634 aa  243  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  40.46 
 
 		 633 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  40.33 
 
 		 644 aa  240  4e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  28.83 
 
 		 631 aa  239  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.27 
 
 		 631 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  40.63 
 
 		 633 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.12 
 
 		 604 aa  232  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  40.66 
 
 		 633 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  40.33 
 
 		 607 aa  230  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  40 
 
 		 633 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.12 
 
 		 645 aa  229  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  40.33 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  39.02 
 
 		 612 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  37.04 
 
 		 567 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  29.39 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  29.8 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 		 638 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 634 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  25.76 
 
 		 788 aa  56.2  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  23.14 
 
 		 547 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  23.14 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 628 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  28.07 
 
 		 628 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 627 aa  52  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.79 
 
 		 626 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  25.79 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  29.78 
 
 		 622 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  25.79 
 
 		 627 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.62 
 
 		 629 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1465  von Willebrand factor type A  29.93 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  25.16 
 
 		 627 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  25.16 
 
 		 627 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  24.06 
 
 		 625 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6286  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 		 631 aa  45.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  28.83 
 
 		 689 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2765  von Willebrand factor type A  28.83 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 		 518 aa  44.3  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>