59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4366 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  64.71 
 
 
573 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  65.92 
 
 
573 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  90.31 
 
 
574 aa  995    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  66.84 
 
 
610 aa  707    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  68.95 
 
 
577 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  100 
 
 
578 aa  1162    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  54.67 
 
 
577 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  48.79 
 
 
563 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.23 
 
 
632 aa  267  4e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  35.77 
 
 
647 aa  266  8.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.16 
 
 
633 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.44 
 
 
633 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.84 
 
 
633 aa  262  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.93 
 
 
631 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.26 
 
 
612 aa  259  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.82 
 
 
634 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.1 
 
 
631 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.24 
 
 
620 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.99 
 
 
633 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.65 
 
 
637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  35.57 
 
 
630 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.73 
 
 
631 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  31.9 
 
 
637 aa  253  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  32.14 
 
 
607 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  32.5 
 
 
633 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  32.01 
 
 
633 aa  253  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  32.47 
 
 
635 aa  251  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.58 
 
 
638 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.03 
 
 
645 aa  250  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.55 
 
 
635 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.55 
 
 
635 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  31.36 
 
 
633 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.1 
 
 
631 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.39 
 
 
632 aa  247  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  31.61 
 
 
619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  31.61 
 
 
619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.21 
 
 
636 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  30.33 
 
 
624 aa  246  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.22 
 
 
644 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.26 
 
 
634 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.94 
 
 
640 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  30.15 
 
 
631 aa  244  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.56 
 
 
637 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  29.67 
 
 
625 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.25 
 
 
604 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  30.64 
 
 
619 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.88 
 
 
622 aa  234  5e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  40.07 
 
 
633 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  34.03 
 
 
622 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  37.39 
 
 
567 aa  88.6  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  32.92 
 
 
582 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  32.92 
 
 
584 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  25.51 
 
 
788 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  24.32 
 
 
629 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  27.52 
 
 
628 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  27.52 
 
 
628 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 
634 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
547 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
547 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>