73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3828 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  100 
 
 		 577 aa  1151    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  56.5 
 
 		 574 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  54.67 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  54.05 
 
 		 577 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  56.22 
 
 		 573 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  54.12 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  54.12 
 
 		 610 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  47.36 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.25 
 
 		 632 aa  278  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  35.51 
 
 		 633 aa  276  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.41 
 
 		 647 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  36.69 
 
 		 630 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.69 
 
 		 620 aa  269  8e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  32.65 
 
 		 625 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  33.44 
 
 		 633 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.31 
 
 		 640 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  34.08 
 
 		 624 aa  259  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.42 
 
 		 633 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.87 
 
 		 645 aa  257  5e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  33.62 
 
 		 633 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  33.69 
 
 		 635 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.5 
 
 		 633 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.83 
 
 		 631 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.27 
 
 		 634 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.45 
 
 		 612 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  34.81 
 
 		 619 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  33.45 
 
 		 637 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  34.81 
 
 		 619 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.5 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  32.5 
 
 		 635 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  34.55 
 
 		 622 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.68 
 
 		 631 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  33.21 
 
 		 619 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  44.41 
 
 		 633 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  33.28 
 
 		 631 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.9 
 
 		 633 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  29.72 
 
 		 631 aa  245  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  31.62 
 
 		 631 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  43.75 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  30.62 
 
 		 644 aa  242  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  31.12 
 
 		 633 aa  240  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  43.05 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  43.65 
 
 		 632 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.58 
 
 		 637 aa  231  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  34.28 
 
 		 622 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  41.25 
 
 		 607 aa  229  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  42.02 
 
 		 634 aa  229  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  41.23 
 
 		 636 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  43.36 
 
 		 637 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  40.98 
 
 		 638 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  36.09 
 
 		 567 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  33.47 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  33.08 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  28.37 
 
 		 788 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 		 634 aa  57.8  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0537  von Willebrand factor type A  25.44 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0534  hypothetical protein  25.44 
 
 		 626 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4677  hypothetical protein  25.81 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1809899999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0590  hypothetical protein  25.44 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0623  hypothetical protein  25.44 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0534  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.44 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0678  hypothetical protein  25.44 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000398257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1634  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 638 aa  50.8  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.233072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0660  hypothetical protein  25.45 
 
 		 627 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  22.64 
 
 		 629 aa  49.3  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0692  hypothetical protein  25.2 
 
 		 627 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0535  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 627 aa  47.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  23.27 
 
 		 628 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  23.27 
 
 		 628 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  24.74 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  24.74 
 
 		 547 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0752  hypothetical protein  24.8 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 		 584 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>