60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1712 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.02 
 
 		 647 aa  770    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  56.54 
 
 		 619 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  54.21 
 
 		 619 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  63.05 
 
 		 633 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.66 
 
 		 633 aa  731    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.87 
 
 		 612 aa  677    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.5 
 
 		 631 aa  752    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.52 
 
 		 637 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 638 aa  1293    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.39 
 
 		 637 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  54.98 
 
 		 624 aa  651    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.2 
 
 		 635 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  59.61 
 
 		 637 aa  709    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.44 
 
 		 634 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.34 
 
 		 630 aa  745    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.82 
 
 		 640 aa  741    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.5 
 
 		 636 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.8 
 
 		 634 aa  746    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.16 
 
 		 633 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.03 
 
 		 644 aa  731    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.2 
 
 		 635 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  63.93 
 
 		 632 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  62.58 
 
 		 633 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  59.74 
 
 		 633 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.66 
 
 		 631 aa  754    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.18 
 
 		 604 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  54.04 
 
 		 626 aa  639    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.72 
 
 		 633 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  53.82 
 
 		 631 aa  647    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  56.54 
 
 		 619 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.51 
 
 		 631 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.35 
 
 		 645 aa  744    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  56.74 
 
 		 607 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.53 
 
 		 631 aa  740    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  62.85 
 
 		 635 aa  747    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.44 
 
 		 632 aa  685    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  58.21 
 
 		 620 aa  685    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  56.01 
 
 		 633 aa  633  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  52.92 
 
 		 625 aa  625  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  57.03 
 
 		 622 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  52.74 
 
 		 633 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  49.17 
 
 		 622 aa  547  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  33.81 
 
 		 563 aa  270  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  32.99 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  29.9 
 
 		 577 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  32.23 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  31.64 
 
 		 574 aa  224  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  31.12 
 
 		 610 aa  220  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  30.91 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  29.53 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  30.23 
 
 		 584 aa  99  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  28.23 
 
 		 567 aa  94.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  30.11 
 
 		 788 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  31.97 
 
 		 582 aa  92  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  27.32 
 
 		 599 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.84 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.84 
 
 		 628 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  24.21 
 
 		 584 aa  51.6  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  26.63 
 
 		 629 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  26.88 
 
 		 634 aa  43.9  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>