62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3590 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.72 
 
 		 634 aa  763    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0079  cobaltochelatase, CobT subunit  55.87 
 
 		 631 aa  710    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7564  aerobic cobaltochelatase subunit CobT  59.81 
 
 		 633 aa  754    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1945  cobaltochelatase, CobT subunit  68.39 
 
 		 637 aa  858    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.290424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2329  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.76 
 
 		 612 aa  648    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  79.9 
 
 		 631 aa  1032    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0915  cobalt chelatase, pCobT subunit  68.99 
 
 		 637 aa  846    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1712  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.39 
 
 		 638 aa  722    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.220052  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.91 
 
 		 637 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3229  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.9 
 
 		 635 aa  763    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.754717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  55.68 
 
 		 647 aa  662    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_004310  BR2021  cobalamin biosynthesis protein, putative  68.39 
 
 		 633 aa  855    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.295725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.23 
 
 		 630 aa  770    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.74 
 
 		 640 aa  756    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3424  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.42 
 
 		 636 aa  759    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0497  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.75 
 
 		 634 aa  754    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  100 
 
 		 633 aa  1290    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0317  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.82 
 
 		 644 aa  758    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0168476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3553  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.9 
 
 		 635 aa  763    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6738  cobalt chelatase, pCobT subunit  62.04 
 
 		 632 aa  765    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  80.73 
 
 		 633 aa  1058    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  97.47 
 
 		 633 aa  1241    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  61.86 
 
 		 645 aa  756    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0543  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.15 
 
 		 631 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  59.81 
 
 		 633 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0286  cobalt chelatase, pCobT subunit  60.03 
 
 		 631 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.349467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3071  cobalt chelatase, pCobT subunit  65.18 
 
 		 631 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2287  cobalt chelatase, pCobT subunit  54.72 
 
 		 632 aa  635    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  61.24 
 
 		 635 aa  753    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2191  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.04 
 
 		 620 aa  642    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1976  aerobic cobalt chelatase, CobT subunit  52.92 
 
 		 619 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0684  cobaltochelatase  52.92 
 
 		 619 aa  609  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  54.19 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0619466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2719  aerobic cobaltochelatase subunit cobT  53.01 
 
 		 624 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2742  cobalt chelatase, CobT subunit  53.54 
 
 		 626 aa  608  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0642  cobalt chelatase, CobT subunit  51.2 
 
 		 625 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0589223  normal  0.0701901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2389  cobalt chelatase, pCobT subunit  53.58 
 
 		 604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3073  cobaltochelatase  52.73 
 
 		 619 aa  600  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1711  cobalt chelatase, pCobT subunit  52.85 
 
 		 622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0115  cobalt chelatase, pCobT subunit  50.16 
 
 		 633 aa  577  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.102217  normal  0.0675463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0207  cobalt chelatase, CobT subunit  50.24 
 
 		 633 aa  560  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0221  Cobaltochelatase  47.2 
 
 		 622 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.435346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1995  cobaltochelatase  32.93 
 
 		 563 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3828  Cobaltochelatase  31.6 
 
 		 577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6208  cobaltochelatase  31.17 
 
 		 577 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.215105  normal  0.873171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4366  Cobaltochelatase  32.1 
 
 		 578 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.639758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0688  putative cobalamin biosynthesis cobT protein  31.65 
 
 		 574 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.811064  normal  0.437479 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1996  cobalamin biosynthesis protein CobT  32.42 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.605161  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4519  cobaltochelatase  32.12 
 
 		 573 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.847873  normal  0.518328 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3756  CobT protein  38.41 
 
 		 573 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.799605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 582 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  29.87 
 
 		 584 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  32.84 
 
 		 567 aa  99.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  28.25 
 
 		 788 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  21.41 
 
 		 572 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 		 533 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1498  hypothetical protein  25.13 
 
 		 628 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239548  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1469  hypothetical protein  25.13 
 
 		 628 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1265  Cobalamin biosynthesis protein CobT (nicotinate- mononucleotide:5 6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase)-like protein  25.85 
 
 		 599 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0237592  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  25.59 
 
 		 662 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  20.65 
 
 		 572 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0978  hypothetical protein  27.22 
 
 		 629 aa  46.2  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.827084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>