54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0265 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 572 aa  1179    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  92.81 
 
 		 572 aa  1042    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  36.72 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.4 
 
 		 598 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 		 584 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  28.89 
 
 		 547 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 		 615 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  27.93 
 
 		 662 aa  183  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  27.85 
 
 		 628 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  38.14 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  25.8 
 
 		 617 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1891  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 518 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.649722  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  35.84 
 
 		 533 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  25.79 
 
 		 601 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 		 696 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5309  von Willebrand factor type A  23.75 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1300  putative cobalamin biosynthesis protein cobT  24.11 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00926856  normal  0.404271 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0109  cobT family protein  28.31 
 
 		 788 aa  77  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.49872e-80  unclonable  2.67705e-133 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  28.15 
 
 		 753 aa  71.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  26.44 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1965  hypothetical protein  22.86 
 
 		 769 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7220  putative cobalamin biosynthesis protein, CobT  29.15 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.557339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3590  cobalt chelatase, pCobT subunit  21.1 
 
 		 633 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94588  normal  0.603807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3883  cobalt chelatase, pCobT subunit  20.83 
 
 		 633 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0499  cobalt chelatase, pCobT subunit  26.85 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  32.76 
 
 		 644 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2996  Zn-dependent peptidase  27.85 
 
 		 315 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0404  cobalt chelatase, CobT subunit  26.39 
 
 		 635 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167561  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2559  cobalt chelatase, pCobT subunit  21.12 
 
 		 631 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  0.478832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3189  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 773 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.903904  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1516  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 		 520 aa  50.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00796283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.38 
 
 		 777 aa  48.9  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1878  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.1 
 
 		 637 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0132  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 781 aa  48.9  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0422  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 		 757 aa  48.1  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1677  von Willebrand factor type A domain protein  26.02 
 
 		 783 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2540  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 		 634 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1375  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 783 aa  47.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4045  cobaltochelatase CobT subunit  20.57 
 
 		 633 aa  47.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.439387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4144  cobalt chelatase, pCobT subunit  22.4 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  25.24 
 
 		 785 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1546  von Willebrand factor, type A  34.71 
 
 		 773 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2663  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 772 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3054  von Willebrand factor type A domain protein  25.3 
 
 		 772 aa  45.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1043  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 		 781 aa  44.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3433  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1644  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 		 636 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3700  cobalt chelatase, pCobT subunit  24.43 
 
 		 634 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.828276  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 		 766 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3426  cobalt chelatase, pCobT subunit  21.79 
 
 		 640 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.23963  normal  0.334691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 785 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0540  cobalt chelatase, pCobT subunit  25.69 
 
 		 633 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6497  cobalt chelatase, pCobT subunit  19.46 
 
 		 630 aa  43.9  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  decreased coverage  0.00510889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2880  VWA containing CoxE family protein  29.17 
 
 		 377 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191674  normal  0.189706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>