19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1292 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1292  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1310    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.88 
 
 		 598 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  26.83 
 
 		 575 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 		 696 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  25.25 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 		 628 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  23.73 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  23.45 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  23.8 
 
 		 615 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  36.59 
 
 		 547 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4064  von Willebrand factor, type A  27.69 
 
 		 584 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  36.07 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3732  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 		 662 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0391  hypothetical protein  28.24 
 
 		 601 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.0515178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2614  von Willebrand factor, type A  34.55 
 
 		 533 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.908666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2996  Zn-dependent peptidase  25.32 
 
 		 315 aa  47.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  31.01 
 
 		 794 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  30.34 
 
 		 490 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 657 aa  43.9  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>