16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4200 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4200  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1009    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5217  von Willebrand factor, type A  24.8 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2920  von Willebrand factor, type A  20.35 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0347292  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0112  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.2 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.237342 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3435  von Willebrand factor, type A  20.35 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.919392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0210  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0265  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4733  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 		 696 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345063  normal  0.296861 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4273  von Willebrand factor, type A  29.38 
 
 		 617 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2875  von Willebrand factor type A  22.91 
 
 		 615 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5495  von Willebrand factor, type A  23.42 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000340066  normal  0.614355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2161  hypothetical protein  23.43 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0430  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 777 aa  45.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.898642  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1498  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 		 785 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2621  rubisco activation protein CbbO  28.31 
 
 		 785 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.808278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1975  nitric oxide reductase activation protein  29.63 
 
 		 786 aa  43.5  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>