More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf733 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf733  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
311 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
281 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  33.91 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  36.77 
 
 
351 aa  94  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  31.31 
 
 
273 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  37.97 
 
 
293 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  34.38 
 
 
282 aa  89.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
368 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4943  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.397095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  25.17 
 
 
272 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
276 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  36.59 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
277 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 
272 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  33.16 
 
 
269 aa  87  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
284 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  32.81 
 
 
296 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  27.96 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  40.68 
 
 
322 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 
342 aa  85.9  8e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
287 aa  85.9  9e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
277 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
267 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0593  phosphatidate cytidylyltransferase  31.96 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  40.49 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  35.97 
 
 
271 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  29.91 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  25.94 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 
273 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1828  phosphatidate cytidylyltransferase  34.71 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.930496 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.83 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  29.61 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  35.25 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  36.41 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  30.85 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  32.82 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3996  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428683  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
271 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
275 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 
271 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  32.32 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  35.36 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  31.65 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  36.7 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  36.91 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  44.86 
 
 
712 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1632  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  29.05 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  38.03 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  32.94 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  39.83 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1443  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  39.34 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 
296 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  37.9 
 
 
273 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  33.53 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>