More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2029 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.5 
 
 		 195 aa  229  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  55.03 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  55.03 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  55.03 
 
 		 193 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  54.5 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  54.26 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  53.97 
 
 		 193 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  53.97 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  53.44 
 
 		 193 aa  208  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  53.44 
 
 		 193 aa  207  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  53.67 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  53.67 
 
 		 193 aa  197  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  55.8 
 
 		 189 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 		 202 aa  184  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  45.73 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  46.91 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3568  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.16 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 		 197 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1114  isopropylmalate isomerase small subunit  44.9 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162514  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.63 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  43.15 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.15 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3620  isopropylmalate isomerase small subunit  44.39 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  45.27 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 212 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  43.94 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  44.44 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 214 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.59 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  164  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3462  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.41 
 
 		 195 aa  164  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0274952  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  45.54 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  44.33 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  45.69 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  45.05 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  43.43 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  44.16 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  45 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  45.54 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 212 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1876  isopropylmalate isomerase small subunit  46.07 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.86 
 
 		 195 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  45.13 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8017  isopropylmalate isomerase small subunit  45.6 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  43.59 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  44.83 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  160  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.91 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.36 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1979  isopropylmalate isomerase small subunit  45.83 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  44.16 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  46.39 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  45.08 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  44.16 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  45.27 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  46.27 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.9 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  43.65 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  43.15 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1590  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.494308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  44.56 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.56 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>