More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1167 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 196 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  57.73 
 
 		 193 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  57.73 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 		 193 aa  227  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 		 193 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  56.7 
 
 		 193 aa  224  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  57.67 
 
 		 193 aa  223  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  60.11 
 
 		 193 aa  218  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.58 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  56.61 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  56.61 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  55.56 
 
 		 189 aa  207  9e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  56.18 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 201 aa  197  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.33 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.52 
 
 		 202 aa  195  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 194 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  46.23 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  51.5 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  47.15 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  50.49 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  52.33 
 
 		 194 aa  191  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.24 
 
 		 195 aa  189  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  47.5 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  47.21 
 
 		 201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  46.63 
 
 		 201 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  49.51 
 
 		 215 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  187  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  52.06 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  51.56 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  45.73 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  49.51 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  46.11 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  48.77 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.33 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  48.76 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  45.32 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  48.47 
 
 		 772 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 202 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  47.78 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  51.78 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  46.8 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  50.52 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>