More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1726 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  62.5 
 
 		 194 aa  229  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  57.59 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  57.59 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  52.58 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  55.06 
 
 		 193 aa  209  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  54.49 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  55.06 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  55.06 
 
 		 193 aa  207  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  56.08 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  54.14 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  53.59 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  54.14 
 
 		 193 aa  207  7e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  54.49 
 
 		 193 aa  207  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  54.49 
 
 		 193 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  55.62 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  51.3 
 
 		 208 aa  200  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  55.76 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0195  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.25 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 200 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.51 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 		 200 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  47.18 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  48.94 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  48.94 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  48.94 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  47.55 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  46.04 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.44 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.19 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  48.97 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  45.73 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 216 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.37 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  47.26 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  47.26 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  47.29 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  46.81 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0279  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.64 
 
 		 195 aa  181  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  45.23 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  47.42 
 
 		 201 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 		 198 aa  180  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  47.03 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.77 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  47.92 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  47.03 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  47.18 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  46.27 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  47.21 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  45.92 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8048  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.65 
 
 		 199 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  0.948646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  44.72 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  45.64 
 
 		 201 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 		 218 aa  177  7e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  46.53 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.67 
 
 		 207 aa  177  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  46.53 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.31 
 
 		 213 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  47.34 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  51.03 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  46.53 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  44.62 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  44.22 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.15 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  46.53 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0076  isopropylmalate isomerase small subunit  46.81 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  47.67 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  44.22 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  46.43 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  47.52 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>