More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1523 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 
193 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  97.41 
 
 
193 aa  397  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  96.37 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  96.89 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  96.37 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  96.37 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  96.37 
 
 
193 aa  394  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  93.78 
 
 
193 aa  384  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  92.23 
 
 
193 aa  380  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  91.71 
 
 
193 aa  354  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  84.75 
 
 
193 aa  324  6e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  59.47 
 
 
190 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  59.47 
 
 
190 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  56.38 
 
 
189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  57.73 
 
 
196 aa  227  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  54.26 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  54.97 
 
 
197 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  54.97 
 
 
197 aa  207  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.49 
 
 
195 aa  207  9e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  51.04 
 
 
194 aa  207  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.88 
 
 
202 aa  205  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.98 
 
 
240 aa  203  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  52.5 
 
 
218 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  48.19 
 
 
201 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 
201 aa  201  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 
201 aa  201  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  52 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  52.24 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  52.24 
 
 
216 aa  197  7e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
212 aa  197  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  48.74 
 
 
201 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 
201 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 
200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.3 
 
 
204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  47.74 
 
 
201 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 
200 aa  194  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  50.77 
 
 
201 aa  194  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 
212 aa  193  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 
200 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
201 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
201 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 
216 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 
201 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 
201 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  49.21 
 
 
201 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 
216 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  51.79 
 
 
200 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  51.02 
 
 
201 aa  191  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.92 
 
 
200 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 
217 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.79 
 
 
201 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 
200 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 
201 aa  191  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 
215 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 
201 aa  190  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 
216 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  46.73 
 
 
201 aa  190  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 
201 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 
212 aa  189  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  48.98 
 
 
201 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 
201 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
215 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.69 
 
 
201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  0.029238 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  49.21 
 
 
722 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  47.69 
 
 
200 aa  188  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 
215 aa  188  2.9999999999999997e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  51.02 
 
 
201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 
201 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 
216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 
216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 
216 aa  188  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.18 
 
 
195 aa  188  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 
216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0126  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 
201 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 
201 aa  188  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0121  isopropylmalate isomerase small subunit  48.17 
 
 
201 aa  188  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886111  normal  0.157977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
215 aa  187  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 
216 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
207 aa  187  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47 
 
 
215 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.52 
 
 
201 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 
216 aa  187  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.76 
 
 
212 aa  187  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0076  isopropylmalate isomerase small subunit  47.64 
 
 
201 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 
216 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  46.46 
 
 
200 aa  186  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 
216 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 
216 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>