More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B3888 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 
193 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  98.45 
 
 
193 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1287  isopropylmalate isomerase small subunit  95.34 
 
 
193 aa  390  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  94.82 
 
 
193 aa  387  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  93.78 
 
 
193 aa  384  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  93.78 
 
 
193 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1314  isopropylmalate isomerase small subunit  93.26 
 
 
193 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1423  isopropylmalate isomerase small subunit  93.26 
 
 
193 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  93.26 
 
 
193 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1325  isopropylmalate isomerase small subunit  92.23 
 
 
193 aa  356  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1126  isopropylmalate isomerase small subunit  84.18 
 
 
193 aa  321  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.76367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2134  isopropylmalate isomerase small subunit  59.47 
 
 
190 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2097  isopropylmalate isomerase small subunit  59.47 
 
 
190 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1672  isopropylmalate isomerase small subunit  57.45 
 
 
189 aa  235  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1167  isopropylmalate isomerase small subunit  57.22 
 
 
196 aa  225  4e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000149275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  56.77 
 
 
197 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2590  isopropylmalate isomerase small subunit  55.21 
 
 
197 aa  210  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000283256  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.45 
 
 
202 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1726  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.06 
 
 
195 aa  209  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2029  isopropylmalate isomerase small subunit  53.44 
 
 
194 aa  208  3e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.22 
 
 
240 aa  207  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  50.52 
 
 
194 aa  206  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 
201 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  50.75 
 
 
201 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
201 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  51.98 
 
 
218 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 
201 aa  201  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.48 
 
 
216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.55 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  51.23 
 
 
216 aa  198  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
201 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 
214 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
212 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  48.47 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 
216 aa  195  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
216 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  51.21 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3758  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  194  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0619  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 
201 aa  194  7e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.79 
 
 
201 aa  193  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 
201 aa  193  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  48.24 
 
 
201 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 
200 aa  193  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 
200 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 
216 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  52.31 
 
 
200 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 
201 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 
215 aa  191  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  49.23 
 
 
201 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  49.23 
 
 
201 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.21 
 
 
195 aa  191  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0338  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 
201 aa  191  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00370617  normal  0.442563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 
216 aa  191  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  51.28 
 
 
200 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  49.74 
 
 
722 aa  191  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.24 
 
 
198 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 
216 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 
216 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  51.02 
 
 
207 aa  190  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 
217 aa  190  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.52 
 
 
201 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  48.5 
 
 
216 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
200 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 
216 aa  190  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  47.24 
 
 
201 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 
201 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  47.42 
 
 
200 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  51.02 
 
 
201 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 
212 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  50.5 
 
 
215 aa  189  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  48.51 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.5 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 
216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 
216 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  47.98 
 
 
200 aa  188  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  49.01 
 
 
214 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0122  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 
201 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14126  normal  0.46492 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 
215 aa  187  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  49.5 
 
 
214 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  49.01 
 
 
214 aa  187  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  48.72 
 
 
201 aa  187  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 
216 aa  187  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  47.32 
 
 
215 aa  187  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
201 aa  187  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  50.51 
 
 
201 aa  187  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.48 
 
 
201 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  48.21 
 
 
201 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  49.01 
 
 
214 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 
200 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0119  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 
201 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>