More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0244 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0244  ABC transporter related  100 
 
 		 531 aa  1034    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.46044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6168  ABC transporter related  42.64 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282987  normal  0.0147704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1269  ABC transporter related  42.26 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0504  ABC transporter related protein  40.11 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6562  ABC transporter related  42.26 
 
 		 559 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0425  ABC transporter related  39.96 
 
 		 569 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1794  ABC transporter related  41.75 
 
 		 550 aa  333  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.224756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1602  ABC transporter-like protein  43.23 
 
 		 547 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  41 
 
 		 631 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3606  ABC transporter related  38.67 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  41.25 
 
 		 536 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  40.6 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  40.6 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  40.6 
 
 		 543 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  42.64 
 
 		 532 aa  326  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  43.14 
 
 		 534 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2533  ABC transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 582 aa  322  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.592005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  39.19 
 
 		 563 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  37.43 
 
 		 555 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 		 557 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  39.29 
 
 		 557 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  37.43 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 535 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2170  ABC transporter related  41.37 
 
 		 579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.65 
 
 		 564 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  39.33 
 
 		 550 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  39.85 
 
 		 552 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  42.8 
 
 		 516 aa  318  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  38.17 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  39.47 
 
 		 553 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0292  ABC transporter foroligopeptide/dipeptide ATP-binding protein  37.92 
 
 		 530 aa  316  5e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7555  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 544 aa  316  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  39.39 
 
 		 552 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3803  ABC transporter related  38.78 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  38.64 
 
 		 556 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1755  ABC transporter  39.04 
 
 		 536 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3476  ABC transporter related  42.56 
 
 		 594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0289183  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3218  ABC transporter related  40.59 
 
 		 585 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  39.54 
 
 		 531 aa  312  9e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3720  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.59645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  36.24 
 
 		 547 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0602  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 539 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.276335 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  37.66 
 
 		 543 aa  310  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3501  ABC transporter related  40.04 
 
 		 549 aa  310  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.480993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  37.85 
 
 		 538 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  41 
 
 		 527 aa  310  5.9999999999999995e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  36.87 
 
 		 562 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  38.55 
 
 		 556 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.29 
 
 		 548 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  39.89 
 
 		 561 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0060  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.721414  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  39.44 
 
 		 537 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  36.69 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3919  ABC transporter related  38.09 
 
 		 543 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29680  ABC transporter, ATP binding component  39.92 
 
 		 537 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0246021  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7051  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 545 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1510  ABC transporter related  40.61 
 
 		 534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.706226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  35.05 
 
 		 571 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  40.19 
 
 		 550 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  39.92 
 
 		 539 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  39.53 
 
 		 539 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  40.04 
 
 		 546 aa  306  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  40.19 
 
 		 549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.35 
 
 		 583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1774  ABC transporter related  37.5 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.846994  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3723  ABC transporter related  38.75 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4210  ABC transporter related  38.7 
 
 		 545 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.355372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  38.22 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1402  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  37.45 
 
 		 534 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.536477  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3682  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  38.77 
 
 		 590 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.732686  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37840  putative ATP-binding component of ABC transporter  38.7 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000360917  normal  0.225303 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3361  ABC transporter related  39.77 
 
 		 550 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.397875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  39.78 
 
 		 558 aa  303  7.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0800  ABC transporter related  38.98 
 
 		 540 aa  303  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.614188  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3530  ABC transporter related  37.96 
 
 		 545 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.463612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3032  peptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.19 
 
 		 525 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158001  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3986  ABC transporter related  39.04 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  36.88 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4377  ABC transporter related  37.76 
 
 		 534 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  39.03 
 
 		 592 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  35.21 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2905  ABC transporter  37.21 
 
 		 525 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3252  peptide ABC transporter ATPase  38.86 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  37.66 
 
 		 583 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  37.81 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24410  ABC transporter  39.25 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870441  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  38.48 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  37.28 
 
 		 524 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  37.83 
 
 		 533 aa  301  3e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0817  ABC transporter related  39.11 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252314  normal  0.0669471 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  38.16 
 
 		 531 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  38.57 
 
 		 575 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3657  ABC transporter related  39.25 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 573 aa  300  5e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  37.96 
 
 		 554 aa  300  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  36.76 
 
 		 530 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  36.76 
 
 		 530 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  38.48 
 
 		 539 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4835  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 572 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.671613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  38.85 
 
 		 565 aa  299  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>