199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4641 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4641  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3512  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.31 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3448  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  42.31 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3430  tetratricopeptide domain-containing protein  39.06 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3366  TPR repeat-containing protein  41.45 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2552  Acyl-(acyl-carrier-protein)--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.34 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0201598  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  27.56 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2383  TPR domain-containing protein  28.91 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.28487e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2055  DNA uptake lipoprotein-like protein  29.56 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000188643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.41 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  30.04 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  28.93 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1710  ComL family lipoprotein  28.44 
 
 		 258 aa  92.4  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00105287  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4007  DNA uptake lipoprotein-like protein  27.5 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0366  DNA uptake lipoprotein  26.98 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  26.64 
 
 		 292 aa  89.4  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11930  competence protein ComL  26.1 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0668  competence lipoprotein ComL  26.32 
 
 		 339 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2065  putative lipoprotein  31.44 
 
 		 243 aa  89  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0622  competence lipoprotein ComL, putative  26.32 
 
 		 339 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258858  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0971  competence lipoprotein ComL  27.69 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0662  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.32 
 
 		 339 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.429425  normal  0.0753816 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.37 
 
 		 288 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4548  competence lipoprotein ComL  26.32 
 
 		 339 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.78 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0475  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.8 
 
 		 256 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0814  putative competence lipoprotein precursor  28.05 
 
 		 254 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.658327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  27.39 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0492  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.8 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000973291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  28.64 
 
 		 298 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4837  competence lipoprotein ComL, putative  26.61 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.616108  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  26.61 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.71 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.45 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  24.7 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  25.54 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  24.32 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0966  putative competence lipoprotein, ComL  26.8 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  27.85 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0968  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.15 
 
 		 330 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.579627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1919  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.527039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1857  competence lipoprotein  25.93 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  25.45 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3612  competence lipoprotein ComL, putative  27.6 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  hitchhiker  0.00362624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  27.6 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1906  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.08 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000817715  normal  0.423153 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  26.89 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.91 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0809  putative competence lipoprotein precursor  29.73 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0753158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.94 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  26.94 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.92 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  25.35 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60230  competence protein ComL  26.34 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000131056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  28.04 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5184  competence protein ComL  26.34 
 
 		 341 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1371  competence lipoprotein ComL  26.67 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.47 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.25 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.97 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.894464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  26.25 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0826  competence lipoprotein ComL, putative  24.09 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  25.51 
 
 		 287 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  24.89 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  25.4 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  26.32 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  28.04 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.57 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1818  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6285  DNA uptake lipoprotein-like  25.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1794  DNA uptake lipoprotein-like protein  25.32 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  23.79 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  28.8 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1325  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.116814  hitchhiker  0.00388547 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  23.79 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0725  competence lipoprotein ComL, putative  23.64 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  25 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  27.57 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  25.7 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5095  DNA uptake lipoprotein-like  24.89 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.1 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  24.9 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>