More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2441 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.13 
 
 		 224 aa  314  6e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.75 
 
 		 224 aa  314  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.5 
 
 		 248 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.77 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  45.83 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 		 246 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.39 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.345481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1028  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  41.32 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242243  normal  0.177071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 248 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 		 249 aa  177  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.28 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.58 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0118382  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 		 247 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00674966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.981974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 		 247 aa  173  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.929403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3677  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.7 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0296  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.62 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  41.25 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.98 
 
 		 240 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  41.35 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  40.65 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  41.63 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.21 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.17 
 
 		 240 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39 
 
 		 245 aa  161  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  40.57 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.98 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0991034  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.06 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  36.48 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  40.41 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  38.52 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.06 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.82 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  40.42 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  37.3 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  38.52 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  40 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.109042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  40 
 
 		 248 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  39.34 
 
 		 246 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  40 
 
 		 248 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2560  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.1 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.562191  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  37.04 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  36.89 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.08 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  37.6 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  38.93 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3711  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  normal  0.265032 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 		 257 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.34 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  40 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.34 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  40.41 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2072  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.1 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.400825 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.56 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.68 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.882283  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>