More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3960 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.39 
 
 
248 aa  344  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.6 
 
 
250 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.4 
 
 
250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.9 
 
 
248 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.9 
 
 
248 aa  298  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.2 
 
 
250 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.93 
 
 
253 aa  289  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.47 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  57.26 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
265 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.43 
 
 
249 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1028  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  58.8 
 
 
250 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242243  normal  0.177071 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
250 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.345481 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
247 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
247 aa  278  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00674966  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
249 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.07 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 
252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 
250 aa  271  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
250 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
246 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 
246 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
248 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
246 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0296  putative short-chain dehydrogenase/reductase  50.4 
 
 
250 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523489  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.54 
 
 
246 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
249 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0118382  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
247 aa  207  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
247 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2719  putative 3-oxoacyl-(Acyl-carrier protein)reductase  42.74 
 
 
248 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114569  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
252 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.109042 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
226 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.63 
 
 
224 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
247 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
252 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
259 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 
245 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.02 
 
 
245 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.26 
 
 
245 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
282 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.458273  normal  0.643271 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
246 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3602  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
245 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0780439  normal  0.144025 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.89 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.68 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
241 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
246 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
250 aa  162  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
277 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
257 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
254 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
250 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
247 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
246 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1897  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.59 
 
 
245 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000114593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.93 
 
 
245 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
252 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.34 
 
 
245 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1626  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.02 
 
 
245 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0813857  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.07 
 
 
246 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3267  putative short chain dehydrogenase/reductase  40.57 
 
 
249 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
258 aa  158  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1057  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  38.27 
 
 
245 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.51 
 
 
246 aa  158  9e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
248 aa  158  1e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0509  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
245 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
246 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  37.9 
 
 
258 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 
245 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
252 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
246 aa  156  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
255 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1200  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.86 
 
 
245 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354003  hitchhiker  0.00226725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
257 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.67 
 
 
245 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 
252 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
249 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.84 
 
 
245 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.42 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.04 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
244 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0745  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  37.45 
 
 
245 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451524  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.33 
 
 
245 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
248 aa  155  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.74 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>