More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4913 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.08 
 
 
248 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.08 
 
 
248 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.64 
 
 
253 aa  323  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.973641  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
250 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.07 
 
 
248 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61 
 
 
248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.689066  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 
247 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00674966  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.41 
 
 
248 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.883232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  58.92 
 
 
248 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
249 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.61 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.55 
 
 
250 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.79 
 
 
249 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.38 
 
 
265 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.73 
 
 
250 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1028  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  57.14 
 
 
250 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242243  normal  0.177071 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.52 
 
 
248 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.2 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.92 
 
 
250 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.345481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.65 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
250 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
246 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
248 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
246 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
246 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.34353  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
246 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
252 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.196327  normal  0.109042 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0296  putative short-chain dehydrogenase/reductase  45.71 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523489  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3040  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
247 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0850209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.55 
 
 
249 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0118382  normal  0.366144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
224 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2719  putative 3-oxoacyl-(Acyl-carrier protein)reductase  45.87 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114569  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
252 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 
252 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
247 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0708885  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
224 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.95 
 
 
226 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
251 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
245 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2224  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
251 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
252 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
246 aa  168  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
260 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.74 
 
 
245 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
258 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3215  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
241 aa  162  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
249 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
246 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.67 
 
 
252 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.89 
 
 
250 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
253 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  39.76 
 
 
257 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
250 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182399  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
247 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4369  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.84 
 
 
246 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
253 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.55 
 
 
250 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3818  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.68 
 
 
245 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0470155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
255 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
247 aa  159  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.17 
 
 
244 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.34 
 
 
245 aa  158  8e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
250 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
252 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 
245 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
245 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
254 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
246 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 
255 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.42 
 
 
245 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
247 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
245 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
254 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0528  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.34 
 
 
246 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
245 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 
246 aa  155  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.96 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
248 aa  155  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
282 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
248 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
272 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
251 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
247 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
246 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0492  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.52 
 
 
246 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.08 
 
 
244 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
262 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.68 
 
 
246 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
264 aa  153  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1896  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.84 
 
 
247 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.176277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.02 
 
 
264 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.02 
 
 
264 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>