More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0621 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0621  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
118 aa  237  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.71 
 
 
372 aa  73.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3212  Rieske 2Fe-2S family protein  36.89 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2590  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.86 
 
 
341 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225432 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2037  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.950553  normal  0.781731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.34 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187317  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1096  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
357 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0810231  normal  0.184537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 
337 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.62 
 
 
373 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.62 
 
 
373 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.37 
 
 
497 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  39.71 
 
 
340 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.37 
 
 
497 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  38.37 
 
 
230 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.27 
 
 
367 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  38.3 
 
 
348 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  38.03 
 
 
358 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  36.36 
 
 
499 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  39.13 
 
 
345 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  38.3 
 
 
376 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  30.69 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  47.76 
 
 
668 aa  58.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  44.78 
 
 
331 aa  57.4  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  26.8 
 
 
347 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  34.62 
 
 
477 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.36 
 
 
362 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  35 
 
 
382 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.35 
 
 
334 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.12 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  32.61 
 
 
369 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  33.02 
 
 
492 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.26 
 
 
377 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 
221 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2310  vanillate monooxygenase  36.84 
 
 
362 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0218143 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  44.12 
 
 
461 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  38.3 
 
 
356 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6709  Rieske (2Fe-2S) protein  32.35 
 
 
373 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.45 
 
 
352 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
374 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.17 
 
 
362 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.1 
 
 
217 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2888  PrnD  38.81 
 
 
370 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942193  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1706  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 
225 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0736967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40 
 
 
437 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  47.69 
 
 
442 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  35.16 
 
 
422 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.93 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.93 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  44.64 
 
 
465 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  34.12 
 
 
367 aa  53.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.98 
 
 
371 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1118  PrnD  37.31 
 
 
346 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  39.47 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2736  PrnD  37.31 
 
 
370 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.36 
 
 
354 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
324 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5267  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
370 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.82 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
321 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  37.37 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4729  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
370 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  38.16 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  35.48 
 
 
338 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
364 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.86 
 
 
361 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.86 
 
 
361 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1267  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  35.35 
 
 
114 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.92 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2688  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 
352 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.68 
 
 
449 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2708  Rieske [2Fe-2S] region  33.65 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104354  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 
354 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  35.05 
 
 
115 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1241  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.15 
 
 
217 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.635525  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
434 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  40.85 
 
 
438 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  42.62 
 
 
443 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
326 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.25 
 
 
344 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
443 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
443 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  31 
 
 
498 aa  50.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.21 
 
 
358 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  35.05 
 
 
359 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.05 
 
 
359 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3968  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.89 
 
 
360 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0886212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 
355 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2904  vanillate O-demethylase, oxygenase subunit  35.71 
 
 
354 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.179444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  34.18 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
443 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.02 
 
 
359 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  40.98 
 
 
443 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
361 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
355 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 
355 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  32.63 
 
 
359 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.51 
 
 
352 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.41 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>