More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0291 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0291  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 367 aa  716    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0128  porphobilinogen deaminase  62.54 
 
 		 333 aa  358  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  48.06 
 
 		 321 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  42.24 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  47.39 
 
 		 307 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  42.77 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  42.37 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  43.93 
 
 		 347 aa  225  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  46.73 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.09 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  48.73 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  42.14 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  45.14 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  46.42 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  46.27 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  44.24 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  44.1 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  45.1 
 
 		 310 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_51811  hydroxymethylbilane synthase  40.31 
 
 		 329 aa  218  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  41.74 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  41.74 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 		 322 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  40.44 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  42.26 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  44.17 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  45.67 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 314 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4020  porphobilinogen deaminase  43.44 
 
 		 309 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3845  porphobilinogen deaminase  43.99 
 
 		 318 aa  212  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  43.12 
 
 		 309 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  42.11 
 
 		 316 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  41.97 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  42.3 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  41.97 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  47.69 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  44.41 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 318 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 320 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  42.19 
 
 		 320 aa  209  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3630  porphobilinogen deaminase  45.62 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0881081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  40.31 
 
 		 320 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 309 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 313 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  41.88 
 
 		 313 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 320 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  37.81 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  41.88 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  43.77 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  39.74 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  43.45 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  44.84 
 
 		 303 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.3 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  39.01 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  42.63 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  43.19 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  41.07 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.65 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  44.05 
 
 		 308 aa  203  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  40.25 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 310 aa  203  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  40.72 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  38.7 
 
 		 309 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  36.51 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  40.12 
 
 		 309 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  42.9 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  48.7 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  42.58 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  42.58 
 
 		 314 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  42.58 
 
 		 314 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  39.88 
 
 		 312 aa  199  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  44.6 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  40.51 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  40.97 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  43.81 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  37.27 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  39.6 
 
 		 319 aa  196  6e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.39 
 
 		 309 aa  196  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 312 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  36.96 
 
 		 316 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>