123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3681 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3681  globin  100 
 
 		 141 aa  283  7e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  75 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  58.62 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  43.08 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  47.06 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  47.06 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  47.06 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  55.65 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  45.76 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  41.07 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  40.52 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  40.17 
 
 		 134 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  37.93 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  42.11 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  31.5 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  34.21 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  34.26 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  34.26 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  32.46 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  34.21 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  36.19 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  33.33 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  31.71 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  34.15 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  32.74 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  26.95 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  29.06 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  29.06 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  34.21 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  33.91 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.23 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  28.95 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  31.03 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  30.97 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  28.07 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.06 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  34.17 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  28.21 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  30.97 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  32.17 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  31.52 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  25.44 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  30.84 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  26.89 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  36.27 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  30.97 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  34.65 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  26.96 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  28.46 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  29.07 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  32.69 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  26.67 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  30.43 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  28.7 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  33.66 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  34 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  25.64 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  25.44 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  29.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  28.28 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  28.28 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  29.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  29.59 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  26.09 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  25.23 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  28.28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  26.13 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  26.05 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  28.28 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  27.27 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  29.06 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  28.69 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  38.61 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  29.09 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  28.57 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  25 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  29.31 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  25.53 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  28 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  25.93 
 
 		 178 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  27.36 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  26.26 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  30.21 
 
 		 357 aa  45.4  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  26.8 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.2 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  35.06 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39797  predicted protein  27.56 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  32.35 
 
 		 257 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  41.67 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  24.22 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  24.22 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  36.71 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>