53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3911 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3911  globin  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  59.84 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  61.54 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  59.17 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  58.33 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  59.17 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  58.33 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  53.85 
 
 		 159 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  36.88 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  37.69 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  42.48 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  38.69 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  42.19 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  39.67 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  37.4 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  38.17 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  38.05 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  33.08 
 
 		 144 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  35.34 
 
 		 175 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  30.95 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  34.21 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  32.46 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  33.33 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  29.84 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  30.7 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  30.7 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  30.7 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  30.83 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  29.82 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  28.15 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  29.82 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  28.7 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  27.12 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  34.19 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  27.59 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  30.7 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  30.51 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  25.64 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  26.96 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  25.22 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  28.07 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  26.21 
 
 		 108 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  33.67 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  30.86 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  31.25 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  31.63 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  32.35 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  32.35 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  29.17 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  20.93 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  20.93 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  22.48 
 
 		 133 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  27.19 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>