48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01283 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  100 
 
 
131 aa  273  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  46.92 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  46.27 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  45.76 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  44.63 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  45.45 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  44.63 
 
 
158 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  44.63 
 
 
147 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  42.48 
 
 
158 aa  99.8  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  40.83 
 
 
159 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  38.1 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  38.17 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  40.32 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  42.11 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  36.03 
 
 
163 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  37.59 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  34.65 
 
 
146 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  37.3 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  31.75 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  35.2 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  39.47 
 
 
175 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  31.4 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  29.31 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  37.76 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  26.09 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  26.09 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  27.13 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  26.09 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  28.46 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  28.07 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  31.86 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  25.64 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  25.64 
 
 
121 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  25.22 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  27.97 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  24.35 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.27 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.34 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  31.52 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  30.48 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  35.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  35.29 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  25.22 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  27.5 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  21.93 
 
 
120 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  30.39 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  30.99 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  27.78 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>