106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2507 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  278  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  63.87 
 
 
124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  63.03 
 
 
124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  60.17 
 
 
121 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  57.38 
 
 
124 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  57.38 
 
 
124 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  51.22 
 
 
124 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  51.64 
 
 
124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  41.03 
 
 
124 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  44.44 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  43.24 
 
 
121 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  40.17 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  42.31 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  45.19 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  40 
 
 
121 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  35.34 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  36.54 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  36.54 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  36.54 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  35 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  37.74 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  38.14 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  33.04 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  33.68 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  33.72 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  31.62 
 
 
122 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  33.02 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  34.13 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  33.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  33.33 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  34.29 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  33.33 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  45.9 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  31.25 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  33.33 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  33.33 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  31.43 
 
 
133 aa  53.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  35.14 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.86 
 
 
252 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.54 
 
 
163 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  29.52 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  29.91 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  29.36 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  28.83 
 
 
129 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  29.52 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  31.63 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  31.36 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  31.58 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  30.85 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  32.79 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  36.11 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  37.14 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  41.94 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  32.41 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  27.62 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  28.69 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  41.38 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  29.81 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  30.77 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  41.38 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  41.38 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  41.38 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  28.04 
 
 
129 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  29.36 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  31.71 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  41.38 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  41.38 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  28.97 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  29.91 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  28.7 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  27.78 
 
 
188 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  26.61 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  23.62 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  38.67 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  38.67 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  29.17 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  38.03 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  31.15 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  30.48 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  26.53 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  29.46 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2371  globin  33.06 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.868938 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  29.9 
 
 
175 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  27.97 
 
 
147 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  25.42 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  35.21 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  31.51 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5102  hypothetical protein  26.85 
 
 
186 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195583  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  26.92 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4363  hypothetical protein  26.28 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  27.78 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4496  hypothetical protein  26.28 
 
 
193 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172585  normal  0.0197975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.58 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  43.33 
 
 
144 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  26.32 
 
 
153 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>