116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1450 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
252 aa  516  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  68.53 
 
 
255 aa  352  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.62 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  57.65 
 
 
257 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  56.94 
 
 
599 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  55.03 
 
 
153 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  53.47 
 
 
161 aa  161  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  42.57 
 
 
152 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  39.29 
 
 
146 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  43.16 
 
 
316 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  35.66 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  31.54 
 
 
151 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  38.89 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  37.9 
 
 
133 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  34.59 
 
 
130 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  38.46 
 
 
125 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  38.38 
 
 
137 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  39.39 
 
 
137 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  34.65 
 
 
178 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  32 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  32.26 
 
 
127 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  32.8 
 
 
142 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  38.1 
 
 
127 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  36.79 
 
 
132 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  34.65 
 
 
188 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  31.78 
 
 
149 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  33.33 
 
 
129 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  31.75 
 
 
139 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  29.6 
 
 
133 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  34.02 
 
 
132 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  31.5 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.05 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.05 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.05 
 
 
132 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  29.46 
 
 
137 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
123 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.05 
 
 
132 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  34.31 
 
 
128 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  34.02 
 
 
132 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  31.2 
 
 
132 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  30.4 
 
 
127 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  32.26 
 
 
124 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  32.98 
 
 
121 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  32.98 
 
 
121 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  28.91 
 
 
149 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  31.34 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  28.57 
 
 
129 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  30.77 
 
 
140 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  33.33 
 
 
129 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  31.68 
 
 
123 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  31 
 
 
129 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  28.8 
 
 
131 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  28.8 
 
 
131 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  28.8 
 
 
131 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
101 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  30.4 
 
 
135 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  28.57 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  32.99 
 
 
147 aa  48.9  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  27.56 
 
 
127 aa  49.3  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  31.58 
 
 
357 aa  48.9  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  32 
 
 
119 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
115 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  33 
 
 
173 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  32.35 
 
 
136 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  32.67 
 
 
121 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  30.3 
 
 
148 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  30.4 
 
 
135 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  33.06 
 
 
133 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3109  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
100 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.852917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.57 
 
 
124 aa  46.6  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  27.2 
 
 
136 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
140 aa  46.6  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
99 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 
99 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  32.04 
 
 
121 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  32.04 
 
 
121 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  32.04 
 
 
121 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  30.63 
 
 
129 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
101 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  28.7 
 
 
124 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  28.89 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  32 
 
 
141 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
97 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
119 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
97 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.43 
 
 
121 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
97 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  30.51 
 
 
136 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  28 
 
 
136 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  35.48 
 
 
124 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  30.25 
 
 
139 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4862  hypothetical protein  29.89 
 
 
96 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241601  normal  0.301328 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>