144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0248 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0248  globin  100 
 
 		 257 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  63.04 
 
 		 255 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.14 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.65 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  58.22 
 
 		 599 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  60 
 
 		 153 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  54.42 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  46.58 
 
 		 152 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  37.93 
 
 		 146 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  44.9 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  35.71 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  37.39 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  37.61 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  34.09 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  38.14 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  34.31 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  36.54 
 
 		 129 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  35.71 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  31.69 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  37.62 
 
 		 127 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  33.85 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  36.7 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  33.08 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4517  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.60105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  35.92 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  33.91 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  32.48 
 
 		 127 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  35.64 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.96 
 
 		 98 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.766751  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  32.48 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  34.26 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  31.45 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  29.03 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  29.03 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  29.03 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  32.35 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  34 
 
 		 137 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  30.39 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4326  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 114 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0188457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1906  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  33.08 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  31.01 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  31.2 
 
 		 133 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  29.57 
 
 		 132 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  30.95 
 
 		 142 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  32.04 
 
 		 132 aa  53.1  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  28.17 
 
 		 142 aa  53.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1109  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 99 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  30.77 
 
 		 123 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  27.78 
 
 		 128 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4403  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 101 aa  52.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171964  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  32.38 
 
 		 126 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  32.17 
 
 		 145 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  27.59 
 
 		 151 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2638  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 99 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2864  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 99 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  29.46 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  30.48 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  30.43 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  30.48 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3482  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.688617  normal  0.1473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  29.69 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  30.48 
 
 		 132 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5978  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4554  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0967865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  29.69 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6274  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 		 119 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  34.62 
 
 		 175 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  31.82 
 
 		 148 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  25.81 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7307  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 123 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163924  normal  0.114263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0539  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 93 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1037  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 99 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415185  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1730  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 99 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198039  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  31.82 
 
 		 136 aa  49.7  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3136  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 140 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  29.13 
 
 		 132 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0526  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 93 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  33 
 
 		 137 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2566  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 100 aa  48.5  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311695  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  27.42 
 
 		 136 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  30.7 
 
 		 357 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1119  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 99 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18496  normal  0.355474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  32.04 
 
 		 121 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.52 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  39.02 
 
 		 121 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>