61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2414 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2414  globin  100 
 
 
146 aa  303  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  37.93 
 
 
257 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.29 
 
 
252 aa  97.1  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  40.82 
 
 
153 aa  94  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  36.17 
 
 
599 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  37.59 
 
 
255 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.3 
 
 
263 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  38.05 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  36 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  30.97 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
324 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  33.86 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  30.28 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  31.43 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  33.33 
 
 
121 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  31.3 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  29.66 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  32.08 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  31.13 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  30.3 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  33 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  38.61 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  29.59 
 
 
119 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  30.83 
 
 
121 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  30.83 
 
 
121 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  37.62 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  29.01 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  29.01 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  29.01 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  30.53 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  31.43 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  31.4 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  31.43 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  31.43 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  29.92 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  40 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  29.03 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0779  globin  29.9 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.388138  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  31.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  31.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  31.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  31.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  31.43 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  29.51 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  31.11 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  30.48 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  30.48 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  27.18 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  32.67 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  32.58 
 
 
147 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  28.93 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  40 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  35.82 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  34.33 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  26.53 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  37.97 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  37.68 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  28.57 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  28.57 
 
 
139 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  28.91 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  32.86 
 
 
132 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>