90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2478 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2478  globin  100 
 
 		 153 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  60 
 
 		 257 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  59.87 
 
 		 255 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.03 
 
 		 252 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.66 
 
 		 263 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  53.1 
 
 		 599 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  47.95 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  48.03 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  40.82 
 
 		 146 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  37.3 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  35.9 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  36.15 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  37.5 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  30.5 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  36.36 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  35.24 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  33.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  32.32 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  29.84 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  32.39 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  34.62 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  35.44 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  32.17 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  28.91 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  29.29 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  33.33 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  31.13 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  27.13 
 
 		 178 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  36.07 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  40 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  28.8 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  29.69 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  29.77 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  31.86 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  31.86 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  31.86 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  31.18 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  32.2 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  31.48 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  29.66 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  27.2 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  29.41 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  28.43 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  31.2 
 
 		 274 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  31 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  30.51 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  28.81 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  36.71 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  33.82 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  28.32 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  28.3 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  25.44 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  26.61 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  31.65 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  27.48 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  28.97 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  27.45 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  30.1 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  30.21 
 
 		 116 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  27.78 
 
 		 357 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  33.33 
 
 		 124 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  29.17 
 
 		 148 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  27.19 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  27.35 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  28.04 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  28.15 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  34.72 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4232  hypothetical protein  35.53 
 
 		 182 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  28.15 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  28.15 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  28.68 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  28.07 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  28.83 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  28.83 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  28.07 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  28.04 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  27.1 
 
 		 136 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>