80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4595 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4891  globin  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  72.03 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  62.61 
 
 		 128 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  47.83 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  47.06 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  46.09 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  37.29 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  44.25 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  44.94 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  36.11 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  44.25 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  36.67 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  36.67 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  34.48 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  33.94 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  29.2 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  36.54 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  36.04 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  45.59 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  32.38 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.31 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  32.17 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  30.7 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  28.32 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  33.62 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  32.17 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  36.59 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  31.3 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  41.24 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  27.43 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  29.2 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  27.43 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  29.31 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  26.72 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  27.19 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  26.55 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  27.43 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  27.43 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  31.19 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  29.31 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  39.22 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  27.68 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  30.17 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  29.31 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  26.09 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  24.56 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  24.35 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  23.89 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  23.15 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  35.29 
 
 		 255 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  38 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  26.77 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  26.52 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  34.31 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  34.31 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  31.86 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  23.68 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  25.98 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  23.21 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 252 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  40.3 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39797  predicted protein  27.35 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  34 
 
 		 257 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  37.18 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  29.87 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  28.43 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  34.15 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  21.74 
 
 		 120 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  34.43 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  29.91 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  30.84 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  35.9 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  30.28 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  35.82 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7107  predicted protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.82 
 
 		 132 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.82 
 
 		 132 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>