32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2180 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2180  globin  100 
 
 		 133 aa  263  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  93.98 
 
 		 133 aa  247  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  93.98 
 
 		 133 aa  246  5e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  53.38 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  54.14 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  42.86 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  41.09 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  40.46 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  23.44 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  27.69 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  28.12 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  24.62 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  28.68 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  26.72 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  27.56 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  21.8 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  26.56 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  26.77 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  26.77 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  24.03 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  28.7 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  26.77 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  23.44 
 
 		 124 aa  47.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  25 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  24.73 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  24.81 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  27.91 
 
 		 174 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  22.48 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  32 
 
 		 124 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  18.32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  28.87 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  26.8 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>