60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1963 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1963  globin  100 
 
 		 175 aa  344  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  47.58 
 
 		 147 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  47.11 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  44.92 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  38.05 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  41.53 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  41.53 
 
 		 142 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  33.33 
 
 		 143 aa  88.2  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  38.79 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  36.28 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  33.61 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  35.34 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  33.33 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  33.9 
 
 		 144 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  39.47 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  30.82 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  30.14 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.5 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  30.14 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  39.56 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  33.04 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  31.03 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  30.4 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  33.33 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  33.04 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  29.17 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  30.33 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  29.31 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  29.31 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  29.31 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  28.21 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  27.59 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  28.7 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  34.09 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  26.55 
 
 		 121 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  32.95 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  27.19 
 
 		 124 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  34.62 
 
 		 257 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  30.93 
 
 		 127 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.45 
 
 		 122 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  24.81 
 
 		 133 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  24.37 
 
 		 120 aa  45.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  24.81 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  24.03 
 
 		 133 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  29.9 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  26.45 
 
 		 121 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  34.29 
 
 		 108 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  27.62 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  26.09 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  29.06 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  32.86 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  28.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  32.86 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  28.21 
 
 		 136 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  29.06 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  32.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  32.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  32.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  32.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  32.86 
 
 		 136 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>