79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0576 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0576  globin  100 
 
 		 121 aa  248  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  60.17 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  55.93 
 
 		 124 aa  137  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  55.56 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  51.22 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  52.63 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  48.78 
 
 		 124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  48.78 
 
 		 124 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  43.22 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  38.66 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  37.29 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  37.29 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  37.29 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  38.14 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  43.22 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  36.75 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  33.9 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  33.61 
 
 		 119 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  33.33 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  33.05 
 
 		 122 aa  73.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  31.86 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  29.91 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  35.87 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  32.48 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  28.81 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  30 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  32.61 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  24.79 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  29.81 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  26.45 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  32.65 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  36.84 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  26.5 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  38.71 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  38.67 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  27.12 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  38.67 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  38.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  38.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  24.37 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  32.61 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  29.7 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  28.28 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  38.67 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  29.17 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  29.17 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  32.67 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  25.71 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  36.67 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  38.67 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  21.78 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  25.86 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  24.79 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  35.14 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  25.62 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  26.42 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  26.27 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  27.5 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  29.73 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  26.13 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  33.64 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  30.67 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  25.58 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  32 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  32.43 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  34.33 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  24.76 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 		 252 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  21.67 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  25.47 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 263 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  22.14 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  31.08 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  28 
 
 		 128 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>