27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_37957 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  41.3 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39797  predicted protein  33.59 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  36.84 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  36.84 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  33.04 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  33.04 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  34.21 
 
 
136 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  33.62 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  33.62 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  33.62 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  31.25 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  32.48 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  33.91 
 
 
119 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  35.09 
 
 
128 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  32.17 
 
 
141 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  29.06 
 
 
127 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  29.41 
 
 
124 aa  58.2  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  29.41 
 
 
124 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  28.7 
 
 
124 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  30.25 
 
 
121 aa  55.5  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  37.5 
 
 
121 aa  51.6  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  31.25 
 
 
121 aa  48.9  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  32 
 
 
125 aa  45.1  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  32.17 
 
 
124 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  27.47 
 
 
108 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  25.23 
 
 
122 aa  41.2  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>