79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1894 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1894  globin  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  41.07 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  39.32 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  40.71 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  38.94 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  37.5 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  41.84 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  35 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  39.47 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  37.19 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  36.04 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  36.04 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  38.82 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  36.04 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  33.05 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  38.61 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  31.3 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  34.21 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  34.45 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  39.6 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.77 
 
 		 163 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  30.77 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  37.14 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  34.75 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  33.61 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  30.83 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  34.82 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  37.27 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  39.76 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  30 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  33.93 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  34.91 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  34.91 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  29.09 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  39.08 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  30.83 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  31.62 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  33.86 
 
 		 146 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  31.86 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  28.32 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  27.27 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  29.46 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  26.79 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  28.45 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  31.86 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  27.12 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  28.92 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  30.84 
 
 		 149 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  31.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  30 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  30.97 
 
 		 132 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  33.68 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  32.63 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  30.09 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  30.09 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  30.09 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  30.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  30.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  30.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  30.09 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  30.3 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  29.2 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  27.16 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  28.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  29.13 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  29.09 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  27.47 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  31.58 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  28.97 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  27.84 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  25.23 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  38.57 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  22.61 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1200  globin  27.35 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  27.83 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  28.71 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  25.86 
 
 		 176 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>