50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1425 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1425  globin  100 
 
 		 146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  47.06 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  38.73 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  42.98 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  39.66 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  31.39 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  34.65 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  36.28 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  37.5 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  33.61 
 
 		 175 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  33.11 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  35.14 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.5 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  30.95 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  30.43 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  28.19 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  32.48 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  32.2 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  33.33 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  26.09 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  27.46 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  32.17 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  32.17 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  32.17 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  30.97 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  30.83 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  29.2 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  27.43 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  24.78 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  28.57 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  26.55 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  25.22 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  36.84 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  26.26 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.72 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  23.21 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  24.35 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  24.81 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1754  globin like protein  24.81 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  25.86 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  24.04 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  24.03 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  25.32 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  24.78 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  24.56 
 
 		 121 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  25.2 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  25.2 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  29.46 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  24.17 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  25 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>