131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2581 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2581  globin  100 
 
 		 119 aa  234  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3681  globin  75 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.18078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2981  globin  59.48 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.175312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11575  hemoglobin glbN  48.28 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3264  globin  54.78 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4508  globin  46.09 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4595  globin  46.09 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4891  globin  46.09 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  43.97 
 
 		 128 aa  97.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2507  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.98006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0187  globin  37.19 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0182  globin  37.19 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.96445  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1894  globin  40.71 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00177457  normal  0.142555 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1552  globin  46.09 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3685  globin  39.67 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  38.6 
 
 		 121 aa  83.6  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3674  globin  38.26 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5169  globin  32.23 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3117  globin  37.17 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.746376  normal  0.148151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2601  hypothetical protein  34.19 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0576  globin  33.61 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3162  globin  32.76 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4821  globin  33.65 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3911  globin  33.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1194  globin  30.97 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3177  globin  31.86 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3176  globin  30.97 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3320  globin  30.97 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  40 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0254  globin  29.31 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3548  globin  26.72 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209186  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1079  globin  32.74 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1809  globin  28.95 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1242  globin family protein  28.95 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.954597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  35.35 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1232  globin protein  29.57 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1229  globin  32.74 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435049  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37957  predicted protein  33.91 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.961244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  40.59 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0373  globin  30.97 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000584442  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4206  protozoan/cyanobacterial globin family protein  28.95 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3940  hypothetical protein  29.82 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304408  hitchhiker  0.00309089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1425  globin  29.2 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0180  globin  36.21 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0645  globin  32.58 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  26.5 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  38.61 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0724  globin  30.23 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2350  globin  31.3 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  35.35 
 
 		 130 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03174  globin family protein  25.86 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1963  globin  28.7 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.230814  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0052  globin  26.89 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  29.09 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  32.67 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  32.38 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  28.83 
 
 		 188 aa  53.9  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  30.63 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  31.48 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  29.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2726  globin  26.5 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2180  globin  26.72 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  31.31 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0578  globin  30.51 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01283  cyanoglobin  25.22 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.678014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2328  globin  24.14 
 
 		 120 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.313085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  30.93 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  30 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  31.13 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  30.61 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  34.48 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2252  globin  21.55 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.457276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  32.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  28.97 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  29.25 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  30.3 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2086  globin  26.15 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19954  predicted protein  29.2 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  30.61 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  31.96 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  30.3 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0655  globin  35 
 
 		 274 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0495224  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  30.77 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4363  hypothetical protein  30.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  31.13 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4496  hypothetical protein  30.33 
 
 		 193 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172585  normal  0.0197975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  28.18 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  31.73 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  37.29 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  37.63 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>