160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2031 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2031  globin  100 
 
 		 153 aa  316  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  76 
 
 		 128 aa  202  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  73.6 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  73.6 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  73.6 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  70.31 
 
 		 136 aa  194  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  68.75 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  67.97 
 
 		 135 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  63.64 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  65.85 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  65.85 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  59.71 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  63.71 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  62.7 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  56.74 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  59.54 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  60 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  60.48 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  58.33 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  54.55 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  59.52 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  59.68 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  57.72 
 
 		 133 aa  149  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  58.06 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  56.93 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  58.87 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  59.35 
 
 		 357 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  60.16 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  59.2 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  57.58 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  56.2 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  59.84 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  56.45 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  52.31 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  55.28 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  51.16 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  51.64 
 
 		 125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  44.72 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  40.94 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  40.32 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  39.52 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  36.89 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  39.52 
 
 		 137 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  36.89 
 
 		 132 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  36.07 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  36.07 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  36.07 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  36.07 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  36.07 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  36.07 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  36.07 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  36.07 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  42.16 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  35.25 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  38.4 
 
 		 141 aa  87  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  38.4 
 
 		 128 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  36.51 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  39.37 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  35.71 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  33.33 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  39.82 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  34.92 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  43.82 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  43.82 
 
 		 121 aa  80.1  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  36 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  36 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  35.71 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  40.62 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  32.64 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  34.07 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  41.57 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  33.85 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  34.11 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  33.33 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  40.95 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  31.25 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  31.25 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  36.8 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  31.25 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  36.46 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  42.55 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  40 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  31.5 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  38.39 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  40 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  40 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  32.86 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  30.15 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  33.33 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  36.54 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  36.75 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  32.56 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  33.33 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  38.61 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  39.58 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  32.48 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  34.78 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  32.06 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  31.34 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>