159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0936 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0936  globin  100 
 
 		 135 aa  280  7.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  71.77 
 
 		 127 aa  187  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  66.67 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  68.85 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  66.41 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  69.17 
 
 		 357 aa  176  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  65.15 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  63.71 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  63.71 
 
 		 150 aa  166  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  66.67 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  63.41 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  61.67 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  60.83 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  57.89 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  61.16 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  55.3 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  57.89 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  61.48 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  55.12 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  58.54 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  54.14 
 
 		 136 aa  142  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  56.56 
 
 		 140 aa  141  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  55.64 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  53.97 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  55.28 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  55.65 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  54.17 
 
 		 188 aa  136  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  53.28 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  57.85 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  53.49 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  53.49 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  53.49 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  50 
 
 		 124 aa  133  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  50.81 
 
 		 178 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  50.77 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  51.16 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  44.72 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  43.9 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  42.28 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  42.52 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  41.8 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  38.28 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  38.28 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  38.28 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  39.34 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  37.5 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  39.17 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  39.53 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  38.26 
 
 		 136 aa  83.6  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  40.35 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  37.5 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  36.84 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  30 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  31.86 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  34.78 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  39.52 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  36.67 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  37.14 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  34.78 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  34.11 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  33.88 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  29.69 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  34.78 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  31.86 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  31.86 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  34.06 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  34.78 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  34.06 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  34.06 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  34.78 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  35.77 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  32.56 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  35.66 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  29.69 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  38.38 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  29.69 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  27.13 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  36.79 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  33.59 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  29.69 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  35.38 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  31.97 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  40.21 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  34.31 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  34.43 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  29.6 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  35.34 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  31.3 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>