148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1316 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1316  globin  100 
 
 
137 aa  279  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  97.81 
 
 
137 aa  273  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  85.4 
 
 
136 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  84.67 
 
 
136 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  84.67 
 
 
136 aa  241  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  83.21 
 
 
164 aa  240  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  83.21 
 
 
136 aa  240  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  83.94 
 
 
136 aa  239  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  83.21 
 
 
136 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  83.21 
 
 
136 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  81.75 
 
 
148 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  81.75 
 
 
136 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  81.75 
 
 
136 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  81.75 
 
 
148 aa  234  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  83.21 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  81.75 
 
 
136 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  81.75 
 
 
136 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  81.75 
 
 
136 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  76.19 
 
 
139 aa  209  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  71.76 
 
 
134 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  74.22 
 
 
147 aa  207  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  70.23 
 
 
134 aa  206  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  70.23 
 
 
134 aa  199  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  63.04 
 
 
141 aa  176  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  63.04 
 
 
141 aa  175  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  65.62 
 
 
136 aa  174  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  65.83 
 
 
142 aa  168  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  61.29 
 
 
128 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  61.42 
 
 
133 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  57.55 
 
 
143 aa  164  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  60.16 
 
 
129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  61.72 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  57.69 
 
 
166 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  55.73 
 
 
134 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  59.5 
 
 
128 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  58.2 
 
 
126 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  49.64 
 
 
137 aa  147  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  54.92 
 
 
129 aa  141  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  52.03 
 
 
131 aa  134  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  52.71 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  52 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  52 
 
 
129 aa  130  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  47.93 
 
 
139 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  46.34 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  40.46 
 
 
143 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  43.2 
 
 
143 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  50 
 
 
139 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  44.72 
 
 
130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  44.54 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  43.94 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  43.44 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  37.12 
 
 
156 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  38.46 
 
 
144 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  41.46 
 
 
130 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  39.71 
 
 
142 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  38.81 
 
 
144 aa  103  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  35.82 
 
 
145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  35.82 
 
 
145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  38.64 
 
 
145 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  39.34 
 
 
136 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  36.92 
 
 
145 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  37.7 
 
 
136 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  42.74 
 
 
145 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  38.52 
 
 
131 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  37.4 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  35.07 
 
 
145 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  37.4 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  36.64 
 
 
145 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  36.64 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  39.52 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  42.06 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  39.2 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  40.94 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  40 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  39.68 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  40.15 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  41.28 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  40.48 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  41.48 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  40.48 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  39.68 
 
 
132 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  39.68 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  39.68 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  39.68 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  39.68 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  39.68 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  39.68 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  39.68 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  38.84 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  41.73 
 
 
132 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  38.84 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  38.02 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  38.02 
 
 
123 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  39.39 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  41.32 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  42.06 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  38.89 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  38.64 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  39.02 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  35.65 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>