153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1098 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1098  globin  100 
 
 
127 aa  263  7e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  80.16 
 
 
127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  77.42 
 
 
133 aa  207  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  78.69 
 
 
149 aa  206  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  80 
 
 
153 aa  203  6e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  73.98 
 
 
148 aa  189  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  71.07 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  68.85 
 
 
135 aa  181  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  68.33 
 
 
137 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  71.67 
 
 
150 aa  180  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  66.67 
 
 
149 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  67.21 
 
 
142 aa  170  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  66.39 
 
 
188 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  67.21 
 
 
173 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  67.21 
 
 
142 aa  169  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  64.17 
 
 
357 aa  167  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  66.67 
 
 
127 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  69.49 
 
 
139 aa  166  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  64.75 
 
 
132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  63.64 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  61.29 
 
 
127 aa  160  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  57.72 
 
 
124 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  61.98 
 
 
145 aa  156  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  63.33 
 
 
140 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  60.66 
 
 
132 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  60.32 
 
 
128 aa  152  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  60.5 
 
 
129 aa  152  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  59.68 
 
 
153 aa  150  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  56.91 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  55.74 
 
 
178 aa  144  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  58.54 
 
 
136 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  59.5 
 
 
129 aa  144  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  56.1 
 
 
136 aa  140  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  52.85 
 
 
131 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  52.85 
 
 
131 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  52.85 
 
 
131 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  47.06 
 
 
125 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  43.33 
 
 
133 aa  100  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  43.33 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  38.71 
 
 
130 aa  92.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  39.17 
 
 
137 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  43.2 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  38.33 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  40.5 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  36.07 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  36.07 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  40.16 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  35.83 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  35.25 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.25 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  39.52 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  35.77 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  40.2 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  41.23 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1989  globin  36.89 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  37.7 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  37.9 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  34.96 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  40.4 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  40.4 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  37.5 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  35.25 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  39.6 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  39.64 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  36.89 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  40.95 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  39.32 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  36.44 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  39.32 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  36.44 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  35.2 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  39.39 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  34.15 
 
 
147 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  28.57 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  30.51 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  30.51 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  39.22 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  28.23 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  40.18 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  40.18 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  40.57 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  40.57 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  40.57 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  34.4 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  40.57 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  40.57 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  27.73 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  38.83 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  32.26 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  37.76 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  67  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  27.73 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  32.79 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  27.73 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>