162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1001 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  100 
 
 
121 aa  255  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  100 
 
 
121 aa  255  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  77.69 
 
 
147 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  52.1 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  52.1 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  52.1 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  52.1 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  51.26 
 
 
132 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  48.74 
 
 
137 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  47.37 
 
 
137 aa  114  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  43.8 
 
 
130 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  42.37 
 
 
125 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  46.02 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  46.49 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  41.07 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  40.18 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  41.03 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  36.89 
 
 
142 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  37.29 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  37.5 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  36.52 
 
 
127 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  46.15 
 
 
135 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  38.14 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  37.5 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  36.44 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  35.54 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  39.67 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  36.75 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  38.14 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  37.1 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  35.9 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  37.7 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  38.98 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  43.82 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  34.75 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  38.66 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  38.66 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  38.66 
 
 
131 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  36.89 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  33.87 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  38.02 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  41.3 
 
 
357 aa  77.4  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  33.61 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  35.96 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  33.88 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  32.76 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  34.21 
 
 
173 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  33.05 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  35.25 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  33.04 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  33.88 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  34.43 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  30.89 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  37.61 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  35.48 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  34.43 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  39.8 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  33.88 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  33.88 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  34.43 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  33.04 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  33.88 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  33.88 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  35.25 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  33.88 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  34.43 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  33.88 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  33.88 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  35.34 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  33.06 
 
 
144 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  35.54 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  34.43 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  35.25 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  33.61 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  29.66 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  33.06 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  33.87 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  35.29 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  33.61 
 
 
136 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  36.73 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  30.51 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  33.06 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  33.61 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  31.86 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  34.43 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  34.43 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  31.3 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  31.45 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  34.43 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  32.23 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  37.5 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>