144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1917 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  100 
 
 		 134 aa  276  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  97.76 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2090  putative oxygen-binding protein (globin)  88.81 
 
 		 134 aa  251  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  85.71 
 
 		 139 aa  240  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  85.83 
 
 		 147 aa  230  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1030  hypothetical protein  74.44 
 
 		 164 aa  213  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  74.44 
 
 		 148 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  74.44 
 
 		 136 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  74.44 
 
 		 136 aa  210  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  74.81 
 
 		 148 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  74.81 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  74.81 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  74.81 
 
 		 136 aa  208  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2302  globin  73.28 
 
 		 136 aa  207  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1667  globin  73.28 
 
 		 136 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2279  globin  73.28 
 
 		 136 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0999  globin  72.18 
 
 		 136 aa  207  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0834187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1316  globin  70.23 
 
 		 137 aa  206  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.129637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2317  globin  72.18 
 
 		 136 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2195  globin  72.18 
 
 		 136 aa  206  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5606  globin-like protein  72.18 
 
 		 136 aa  205  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.62023  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3244  putative oxygen-binding protein, globin-like  70.23 
 
 		 137 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2049  globin  68.42 
 
 		 141 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.366529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  63.08 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2781  globin  61.42 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.778315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3454  globin  61.42 
 
 		 141 aa  169  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273084  normal  0.734777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  65.55 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0847  globin  60 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  63.11 
 
 		 128 aa  166  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  59.69 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  60.83 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  62.18 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4036  globin  61.29 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0945  globin  60.63 
 
 		 166 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  60.83 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  60.5 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  52.38 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  54.33 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  52.1 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  55.17 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1263  globin  52.42 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.932923 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1548  heme-binding protein, putative  52.42 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  49.17 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  47.11 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1326  globin  49.14 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  43.75 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  46.22 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  41.86 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00030  putative hemoglobin-like oxygen-binding protein  43.2 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0488861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  43.09 
 
 		 144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  41.46 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0046  globin  44.35 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0363016  normal  0.25879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3728  globin  45.16 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.325061  hitchhiker  0.00731261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  41.09 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  44.34 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  38.17 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4060  globin family  44.72 
 
 		 145 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.171574 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  38.17 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  38.76 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18050  globin-like protein  41.18 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0868344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0034  globin  41.46 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.674256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0031  globin  40.65 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0800503  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0039  globin  40.65 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372259  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0038  globin  40.65 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000122438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0038  globin  40.65 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  unclonable  0.00000927103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  39.02 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  39.84 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  44.44 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.4456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  37.4 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  39.55 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  40 
 
 		 144 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2614  globin  47.73 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.307504  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  38.58 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  36.59 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  38.58 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  37.8 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  38.71 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1767  globin  41.18 
 
 		 137 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  37.8 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  37.8 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3575  globin  47.47 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.425401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  37.8 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  37.8 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  37.8 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  39.85 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  38.66 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  40.6 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  37.01 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  40 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  38.66 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  37.9 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  39.37 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0069  globin  39.45 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  38.76 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  37.59 
 
 		 188 aa  85.1  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  39.17 
 
 		 140 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  39.67 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>