153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12495 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12495  hemoglobin-like oxygen-binding protein glbO  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.134199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2572  globin  79.37 
 
 
136 aa  213  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221799  normal  0.878587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4066  globin  80.16 
 
 
136 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.667271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3610  globin  79.37 
 
 
131 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3683  globin  79.37 
 
 
131 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.88101  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3615  globin  79.37 
 
 
131 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2031  globin  76 
 
 
153 aa  202  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.250624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1391  globin  65.87 
 
 
135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.376518  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11810  truncated hemoglobin  67.74 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1823  globin  69.11 
 
 
145 aa  167  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000381812  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1135  globin  64 
 
 
127 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5317  globin  67.48 
 
 
139 aa  164  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0702045  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09780  truncated hemoglobin  65.04 
 
 
357 aa  160  5.0000000000000005e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  62.9 
 
 
173 aa  159  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1149  globin  63.71 
 
 
140 aa  157  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.572775  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1609  globin  63.2 
 
 
132 aa  157  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.650446  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1333  globin  63.71 
 
 
127 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.143229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7355  hypothetical protein  61.11 
 
 
132 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4636  globin  65.32 
 
 
150 aa  152  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0856308  normal  0.0106718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7353  globin  61.6 
 
 
129 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1098  globin  60.32 
 
 
127 aa  152  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.18171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1533  globin  61.79 
 
 
129 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.331833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24650  truncated hemoglobin  58.4 
 
 
133 aa  148  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0487801  normal  0.249418 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3538  globin  61.79 
 
 
142 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.637564  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11540  truncated hemoglobin  60.98 
 
 
148 aa  147  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1359  globin  60.16 
 
 
127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267788  decreased coverage  0.00000213655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2637  globin  60.98 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3913  globin  60.16 
 
 
142 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.237071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2215  hypothetical protein  57.26 
 
 
188 aa  140  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307711  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0936  globin  55.65 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3533  globin  56.45 
 
 
149 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2414  globin  54.03 
 
 
137 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0149997  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2168  globin  53.23 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000874397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2550  globin  56.8 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.881272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1376  globin  50 
 
 
124 aa  124  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09000  truncated hemoglobin  48.39 
 
 
178 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0562006  normal  0.0132331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1225  globin  46.72 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0341074  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2370  globin  41.94 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0771  globin  40 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0783  globin  41.46 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1355  globin family protein  36.51 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1243  globin  39.52 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1105  globin  36.51 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1116  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1209  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1317  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.997153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1098  globin family protein  35.71 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1092  globin family protein  35.71 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.720422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1279  globin family protein  35.71 
 
 
132 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1626  globin  38.4 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4091  globin family protein  35.71 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1250  globin family protein  34.92 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0911  globin  34.92 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0410  globin  43.24 
 
 
144 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.236118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1800  globin family protein  39.2 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1878  hypothetical protein  39.34 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3955  globin  37.21 
 
 
128 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.405628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3650  globin  41.58 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.260647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2346  globin  44.33 
 
 
142 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2419  globin  38.4 
 
 
123 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1001  globin  37.5 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.621706  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1020  globin  37.5 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0280188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1997  hypothetical protein  36.29 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.174841  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1355  globin  38.24 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.610023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0582  hypothetical protein  34.92 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.709558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3147  conserved hypothetical globin-like protein  41.59 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0120923  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1464  putative globin  38.1 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0042  globin  35.25 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0182573  hitchhiker  0.000000860997 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0774  putative oxygen-binding protein (globin)  37.5 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.207145 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0031  globin  35.25 
 
 
156 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058274  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0036  globin  34.43 
 
 
145 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0572064  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0132  globin  40 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1917  globin  42.27 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626219  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3254  globin  42.55 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1573  globin  37.1 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.732575 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0034  globin  34.43 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0103941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0697  globin  42.71 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.462727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2241  globin  42.27 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.694262 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3444  hypothetical protein  37.01 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.237349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0039  globin  32.54 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.102658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2018  globin  39.8 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3010  globin  38.32 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3575  hemoglobin-like protein  38.78 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0051  globin  32.26 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294967  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2697  putative globin  39.62 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1256  globin  43.16 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.331075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0039  globin  34.43 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1867  hypothetical protein  36.43 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0935  hypothetical protein  41.24 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1401  hypothetical protein  36.43 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0031  globin  33.06 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0030771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1095  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0772  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1253  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1261  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.100755  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0378  hypothetical protein  36.43 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5890  putative hemoglobin protein (truncated hemoglobin)  37.5 
 
 
152 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2330  globin  34.92 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260372  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0899  globin  40.21 
 
 
147 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3261  globin  35.4 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.4456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>